O Sistema de Protocolo da HORUS SOLUÇÕES INTEGRADAS, visa automatizar e documentar o processo de protocolo e tramitação de documentos dos órgãos públicos, efetuando o registro de seus documentos, acompanhando em tempo real o andamento de solicitações e sua respectiva tramitação. Em uma esfera pública, controlar a entrega de documentos para os contribuintes é procedimento muito importante. Desta forma, o módulo de Protocolo da HORUS permite: tramitar documentos em vários setores da entidade; exigir dependências de entrega de documentos para despacho do processo; exigir prazos definidos para entrega de protocolos; realizar cobrança de taxas por tramitação em determinado tipo de documento; cadastrar tipos de documentos com sequência definida; fazer controle de numeração de protocolos; consultar em tempo real atual localização de um protocolo; emitir etiquetas com código de barras para serem afixadas em processos, dentre outras funcionalidades.